MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA03

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019440	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019440	GCT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019440	ATTT	2	8	872	879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019440	T	8	8	877	884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019440	A	7	7	927	933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019440	A	7	7	1007	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019440	T	6	6	1024	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019440	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019440	ATA	2	6	1076	1081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019440	ATT	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019440	CATTGT	2	12	1167	1178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019440	TAG	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019440	AAT	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019440	CAAA	2	8	1299	1306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019440	A	6	6	1338	1343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019440	TTA	2	6	1536	1541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019440	CTTT	2	8	1581	1588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019440	T	6	6	1610	1615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019440	AGT	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019440	CAGA	2	8	1710	1717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019440	TGCT	2	8	1749	1756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019440	T	8	8	1798	1805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019440	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019440	TGC	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019440	AGTA	2	8	5853	5860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019440	GAT	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019440	AG	3	6	6732	6737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019440	GCTT	2	8	6792	6799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019440	AGT	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019440	AGT	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019440	TAA	2	6	6964	6969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019440	A	6	6	6986	6991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019440	ATA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019440	AT	3	6	7504	7509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019440	ATA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019440	TACAA	2	10	7578	7587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019440	AAT	2	6	7621	7626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019440	ACGTC	2	10	7913	7922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019440	TAA	2	6	7998	8003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019440	AGTC	2	8	8121	8128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019440	ACC	2	6	8167	8172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019440	CGTC	2	8	8207	8214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019440	GTCC	3	12	8220	8231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019440	CAT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019440	GAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019440	TGA	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019440	ATA	2	6	8324	8329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019440	TA	3	6	8334	8339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019440	TTAA	2	8	12572	12579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019440	TAC	2	6	12608	12613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019440	ATT	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019440	AGT	2	6	12631	12636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019440	TAC	2	6	12717	12722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019440	ATT	2	6	12728	12733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019440	AGT	2	6	12741	12746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019440	GTG	2	6	13000	13005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019440	C	6	6	13023	13028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_019440	TGAA	2	8	13232	13239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019440	GTC	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019440	TTTTG	2	10	13278	13287	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019440	AAT	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019440	GAT	2	6	13362	13367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019440	TA	3	6	13378	13383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019440	ATA	2	6	13396	13401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019440	TGT	2	6	13416	13421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019440	T	6	6	14514	14519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019440	TAA	2	6	14571	14576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019440	CTA	2	6	14577	14582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019440	GAA	2	6	15064	15069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019440	T	6	6	15107	15112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019440	T	8	8	15125	15132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019440	TAT	2	6	15138	15143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019440	CAA	2	6	15144	15149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019440	AT	3	6	15174	15179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019440	T	7	7	15193	15199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019440	TAT	2	6	15205	15210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019440	CAA	2	6	15211	15216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019440	AT	5	10	15241	15250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019440	AGAA	2	8	15253	15260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019440	GAA	2	6	15294	15299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019440	TTA	2	6	15331	15336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019440	A	7	7	15365	15371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019440	TC	3	6	15379	15384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019440	CGT	2	6	15398	15403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019440	TC	3	6	15476	15481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019440	AAT	2	6	16973	16978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019440	TGT	2	6	17034	17039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019440	ATAA	2	8	17102	17109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019440	TAA	2	6	17112	17117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019440	AGT	2	6	17729	17734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019440	AAT	2	6	17738	17743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019440	GTT	2	6	18488	18493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019440	TAT	2	6	18590	18595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019440	GCAA	2	8	19888	19895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.